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Cell:新研究揭示人体体液中存在6种胞外RNA货物类型

日期:2019-05-09 00:34:03 来源: 生物谷 点击:

在一项新的研究中,为了开发由胞外RNA(extracellular RNA, exRNA)介导的细胞-细胞通讯图谱,美国国家卫生研究院(NIH)胞外RNA通讯联盟(NIH Extracellular RNA Communication Consortium)创建了exRNA图谱资源(https://exrna-atlas.org)。相关研究结果发表在2019年4月4日的Cell期刊上,论文标题为“exRNA Atlas Analysis Reveals Distinct Extracellular RNA Cargo Types and Their Carriers Present across Human Biofluids”。

图片来自Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2019.02.018。
这种exRNA图谱版本4P1包含来自19项研究的5309个exRNA-seq和exRNA qPCR图谱,以及一套分析和可视化工具。

为了分析这些图谱之间的差异,这篇论文的作者应用计算反褶积方法(computational deconvolution)。这种分析产生了一种具有六种exRNA货物类型(CT1,CT2,CT3A,CT3B,CT3C,CT4)的模型,每种类型都可在多种人体生物体液(血清,血浆,脑脊髓液,唾液和尿液)中检测到。其中的五种exRNA货物类型与已知的囊泡和非囊泡(脂蛋白和核糖核蛋白)exRNA载体相关。

为了验证这种模型的效用,这些作者通过反褶积方法重新分析了一项运动反应研究,鉴定出之前未检测到的生理学相关的反应途径。为了实现这种模型的广泛应用,作为exRNA图谱资源的一部分,他们还提供了对用户提供的病例对照研究进行反褶积和分析的工具。

参考资料:

Oscar D. Murillo et al. exRNA Atlas Analysis Reveals Distinct Extracellular RNA Cargo Types and Their Carriers Present across Human Biofluids. Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2019.02.018.

(责任编辑:sgx)

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